هدف این مقاله بررسی تأثیر استقلال حسابرسان بر ضعف در کنترل های داخلی پس از تصویب دستورالعمل کنترل های داخلی توسط سازمان بورس و اوراق بهادار است. برای آزمون فرضیه پژوهش نمونه ای شامل 114 شرکت، از شرکت های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران بعد از تصویب دستورالعمل کنتر لهای داخلی از سال 1391 تا 1395 انتخاب شد. همچنین برای تجزیه و تحلیل داده ها از مدل لجستیک (تحلیل چندمتغیره) و آزمون ویلکاکسون (تحلیل تک متغیره) از نرم افزار STATA و Eviews استفاده شده است. یافته های پژوهش حاکی از عدم وجود تأثیر معنادار استقلال حسابرس بر ضعف کنترل های داخلی می باشد. نتایج پژوهش می تواند بیانگر این موضوع باشد که افشای ضعف در کنترل داخلی شرکت ها به استقلال حسابرسان ارتباط نداشته و حسابرسان با هر درجه ای از استقلال در گزارش خود به ضعف های با اهمیت در کنترل های داخلی اشاره م یکنند. اشاره به ضعف کنتر لهای داخلی، به عنوان یک روش مستندسازی، ممکن است منجر به کاهش مسئولیت قانونی حسابرسان در صورت رخداد تحریفی ناشی از ضعف سیستم کنترل داخلی شود.